Der Wilhelma-Anlagenkomplex für afrikanische Huftiere bildet mit seinen 12 Außengehegen einen Schwerpunkt im oberen Teil der Wilhelma. Dort leben Giraffen, Okapis, Zebras, die seltenen Somali-Wildesel, Strauße und verschiedene Antilopenarten, wie z. B. Nyalas oder Bongos. Löwen, Tiger, Leoparden, Indische Elefanten, die urtümlich wirkenden Panzernashörner, die merkwürdigen Hirscheber-Wildschweine aus Sulavesi, Flusspferde und Schabrackentapire gehören natürlich auch zum Tierbestand der Wilhelma.

Auf dem Schaubauernhof leben alte, gefährdete Haustierrassen neben ihren wilden Vorfahren, so z. B. Wildschweine neben den Schwäbisch-Hällischen Schweinen oder Bezoarziegen und Zwergziegen, die man im Streichelgehege auch anfassen und füttern darf. Außerdem haben dort u a. Kamele, Przewalski-Pferde, Wisent und Mesopotamische Damhirsche eine neue Heimat gefunden. Eine attraktive Freianlage beherbergt Tiere Südamerikas wie Alpakas und Vikunjas. Dazu kommen noch die größten Nagetiere der Welt, die Wasserschweine, sowie Maras, Nandus und Ameisenbären.